Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sde2Q8K1J5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms