Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms