Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CC96 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8CC96 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8CC96 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8CC96 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms