Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp20Q8C6M1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp20Q8C6M1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp20Q8C6M1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp20Q8C6M1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp20Q8C6M1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp20Q8C6M1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp20Q8C6M1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp20Q8C6M1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms