Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Atg16l1Q8C0J2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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