Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim35Q8C006 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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