Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Fam53cQ8BXQ8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fam53cQ8BXQ8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Fam53cQ8BXQ8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Fam53cQ8BXQ8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam53cQ8BXQ8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Fam53cQ8BXQ8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam53cQ8BXQ8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms