Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Usp38Q8BW70 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Usp38Q8BW70 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp38Q8BW70 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp38Q8BW70 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp38Q8BW70 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usp38Q8BW70 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usp38Q8BW70 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usp38Q8BW70 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usp38Q8BW70 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usp38Q8BW70 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Usp38Q8BW70 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Usp38Q8BW70 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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