Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bicd1Q8BR07 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms