Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdca8Q8BHX3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms