Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc50Q810U5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms