Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ttc28Q80XJ3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ttc28Q80XJ3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ttc28Q80XJ3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ttc28Q80XJ3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ttc28Q80XJ3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ttc28Q80XJ3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ttc28Q80XJ3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ttc28Q80XJ3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ttc28Q80XJ3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ttc28Q80XJ3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc28Q80XJ3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms