Protein–RNA interactions for Protein: Q80V63

Prdm4, PR domain zinc finger protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm4Q80V63 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms