Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Polr2eQ80UW8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms