Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpap1Q80TE0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpap1Q80TE0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms