Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp3Q7TNH6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms