Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Msrb2Q78J03 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Msrb2Q78J03 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms