Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6PD19 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6PD19 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q6PD19 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q6PD19 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q6PD19 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6PD19 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms