Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zbtb40Q6PCS8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Zbtb40Q6PCS8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Zbtb40Q6PCS8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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