Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gapvd1Q6PAR5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gapvd1Q6PAR5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms