Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rexo4Q6PAQ4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms