Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gga2Q6P5E6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms