Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Podnl1Q6P3Y9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms