Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrimpolQ6P1E7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PrimpolQ6P1E7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms