Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HelbQ6NVF4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms