Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc66Q6NS45 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms