Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn4Q69Z26 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn4Q69Z26 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms