Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms