Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp4aQ64436 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms