Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf4Q64287 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf4Q64287 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms