Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CochQ62507 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CochQ62507 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CochQ62507 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CochQ62507 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms