Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga3Q62470 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms