Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3gl2Q62420 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3gl2Q62420 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms