Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ss18Q62280 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ss18Q62280 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ss18Q62280 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ss18Q62280 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ss18Q62280 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ss18Q62280 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ss18Q62280 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ss18Q62280 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ss18Q62280 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ss18Q62280 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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