Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sprr1bQ62267 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms