Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sox19Q62249 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sox19Q62249 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sox19Q62249 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sox19Q62249 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sox19Q62249 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sox19Q62249 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sox19Q62249 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sox19Q62249 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sox19Q62249 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sox19Q62249 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sox19Q62249 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sox19Q62249 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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