Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssr4Q62186 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms