Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3bQ62177 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3bQ62177 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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