Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh1a2Q62148 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a2Q62148 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms