Protein–RNA interactions for Protein: Q61884

Mns1, Meiosis-specific nuclear structural protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mns1Q61884 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mns1Q61884 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mns1Q61884 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mns1Q61884 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mns1Q61884 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mns1Q61884 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mns1Q61884 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mns1Q61884 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mns1Q61884 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mns1Q61884 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mns1Q61884 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms