Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga7Q61738 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms