Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamb3Q61087 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms