Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ncor1Q60974 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ncor1Q60974 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ncor1Q60974 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ncor1Q60974 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ncor1Q60974 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ncor1Q60974 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ncor1Q60974 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ncor1Q60974 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ncor1Q60974 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ncor1Q60974 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ncor1Q60974 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ncor1Q60974 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ncor1Q60974 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ncor1Q60974 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ncor1Q60974 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ncor1Q60974 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ncor1Q60974 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ncor1Q60974 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ncor1Q60974 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ncor1Q60974 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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