Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnot7Q60809 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Cnot7Q60809 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Cnot7Q60809 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Cnot7Q60809 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Cnot7Q60809 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Cnot7Q60809 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnot7Q60809 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms