Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf3Q60803 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf3Q60803 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms