Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samhd1Q60710 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samhd1Q60710 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms