Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms