Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsr1Q5SWD9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms