Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam71bQ5STT6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam71bQ5STT6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms