Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf3Q5HZG4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms